竞赛由江苏省生物医学工程学会主办,徐州医科大学、江苏省生物医学工程学会教育与科普专业委员会承办,徐州医科大学医学影像学院、生物医学工程国家级实验教学示范中心(东南大学)协办。
竞赛设立组织委员会,由主办单位、承办单位、协办单位的有关领导与专家组成,负责竞赛的组织工作,决定竞赛的重要事项并指导竞赛的相关工作,审核并决定下一届竞赛的承办单位。设立竞赛评审委员会,主持竞赛的预赛入围评审、决赛终审评审和竞赛技术咨询等工作。
在竞赛组织委员会领导下设立竞赛工作组,包括组长一人、成员若干人;设置秘书组和联络组。
秘书组负责竞赛日常工作,宣传报道、报名统计、竞赛组织、经费管理、赛后总结等工作。联络组负责各高校之间竞赛相关事宜的联系与处置。